76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3317 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 357 aa  743    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  45.3 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  42.94 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 		 377 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  26.65 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  27.79 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  27.89 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  26.25 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  25.67 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 		 489 aa  95.9  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  24.78 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  23.95 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  24.64 
 
 		 588 aa  92.8  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  23.82 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  24.43 
 
 		 601 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  29.79 
 
 		 573 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  20.71 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  27.53 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  24.22 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  22.97 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  21.85 
 
 		 900 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  24.02 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  22.58 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  26.84 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 501 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  22.32 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  25 
 
 		 481 aa  59.3  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  24.04 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  23.46 
 
 		 847 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  27.66 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  24.26 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  26.42 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  24.04 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  21.97 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  37.08 
 
 		 827 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.71 
 
 		 673 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  24.29 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  23.68 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  22.84 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  25.36 
 
 		 566 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  21.43 
 
 		 551 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  40.91 
 
 		 725 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4237  glycoside hydrolase family 5  24.3 
 
 		 653 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  24.77 
 
 		 431 aa  49.7  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  23.19 
 
 		 483 aa  49.3  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  24.04 
 
 		 356 aa  49.7  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  28.57 
 
 		 869 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  25.9 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  27.87 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  24.38 
 
 		 590 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  24.08 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  24.62 
 
 		 705 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  27.05 
 
 		 461 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  23.47 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  22.8 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  41.18 
 
 		 831 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  24.66 
 
 		 853 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  24.51 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  28.21 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  39.68 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  23.08 
 
 		 481 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  22.63 
 
 		 635 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>