37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3335 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  100 
 
 		 578 aa  1163    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  60.38 
 
 		 681 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  53.76 
 
 		 593 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  48.85 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  48.5 
 
 		 589 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  33.84 
 
 		 743 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  30.67 
 
 		 545 aa  266  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  33.11 
 
 		 572 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 		 814 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  31.04 
 
 		 516 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  28.49 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  27.84 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  30.57 
 
 		 621 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  31.03 
 
 		 451 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.87 
 
 		 900 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  29.97 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  27.69 
 
 		 584 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  29.03 
 
 		 335 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 343 aa  96.3  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 335 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.86 
 
 		 312 aa  80.1  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  26.18 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  25.21 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.48 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  25.21 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 		 493 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  27 
 
 		 378 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  23.76 
 
 		 382 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  23.03 
 
 		 470 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  32.63 
 
 		 333 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  29.13 
 
 		 336 aa  48.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  27.21 
 
 		 1302 aa  47.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1167 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>