32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5064 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 378 aa  766    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  33.24 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  27.73 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  26.65 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  26.4 
 
 		 588 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 332 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.68 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.4 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  22.89 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.98 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  26.55 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  21.08 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  21.91 
 
 		 900 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 365 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4237  glycoside hydrolase family 5  25.62 
 
 		 653 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  27 
 
 		 578 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  25.22 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  26.46 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  20.25 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  29.51 
 
 		 551 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  30.16 
 
 		 593 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  23.19 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  24.62 
 
 		 743 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>