21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5358 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 414 aa  813    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  35.07 
 
 		 425 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.34 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  27.86 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  27.87 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  23.01 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  22.6 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  22.46 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  21.86 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4237  glycoside hydrolase family 5  24.7 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  22.66 
 
 		 588 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 335 aa  57  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 		 332 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 365 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.58 
 
 		 584 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>