61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39160 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  77.34 
 
 
481 aa  778    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  100 
 
 
483 aa  996    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  90.02 
 
 
481 aa  880    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  48.43 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  39.04 
 
 
456 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  32.49 
 
 
493 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 
489 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  28 
 
 
601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  27.94 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 
468 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  26.88 
 
 
590 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 
847 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.79 
 
 
863 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.1 
 
 
673 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  22.52 
 
 
1115 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  26.97 
 
 
853 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 
705 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  27 
 
 
869 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 
501 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  27.27 
 
 
498 aa  68.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 
343 aa  67  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25.26 
 
 
332 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 
365 aa  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 
329 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  25.68 
 
 
331 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 
377 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 
814 aa  60.1  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  24.09 
 
 
551 aa  60.1  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 
343 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.44 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 
411 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26901  predicted protein  28.12 
 
 
1082 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0257796  normal  0.0277181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  27.07 
 
 
561 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  27 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  24.81 
 
 
584 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  22.33 
 
 
566 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  22.13 
 
 
562 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  24.12 
 
 
542 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  33.86 
 
 
831 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  20.32 
 
 
608 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  26.9 
 
 
378 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  24.49 
 
 
335 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  22.26 
 
 
312 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  26.21 
 
 
382 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 
335 aa  50.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  30.6 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  26.39 
 
 
661 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  22.54 
 
 
328 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  21.76 
 
 
337 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 
337 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  27.59 
 
 
438 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  30.7 
 
 
401 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  23.79 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  22.54 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  17.51 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  25.79 
 
 
368 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  19.84 
 
 
580 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  25.23 
 
 
593 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  21.86 
 
 
900 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  21.07 
 
 
502 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>