100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  100 
 
 		 601 aa  1189    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  62.13 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  31.75 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  26.53 
 
 		 1115 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  27.72 
 
 		 863 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  29.31 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.93 
 
 		 673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  29.6 
 
 		 481 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  34.29 
 
 		 853 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  30.47 
 
 		 470 aa  120  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  28 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  27.8 
 
 		 481 aa  115  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 		 847 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  31.06 
 
 		 705 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 343 aa  93.6  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  29.17 
 
 		 869 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  34.22 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  30.65 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  27.98 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  28.63 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  27.52 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  21.9 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  28.48 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  30.77 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  24.19 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  24.69 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  26.64 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  23.53 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  26.4 
 
 		 458 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 365 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  27.6 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  34.46 
 
 		 620 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  30.94 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  26.92 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  25.58 
 
 		 1414 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  23.1 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  25.6 
 
 		 526 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  28.34 
 
 		 831 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26901  predicted protein  25.97 
 
 		 1082 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0257796  normal  0.0277181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  31.65 
 
 		 434 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 		 440 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 365 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 		 393 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  27 
 
 		 470 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  25.62 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  22.18 
 
 		 312 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 562 aa  51.2  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  20.82 
 
 		 335 aa  50.8  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92070  predicted protein  28.48 
 
 		 770 aa  50.8  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 633 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  22.79 
 
 		 597 aa  50.8  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  21.91 
 
 		 411 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 658 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  25.09 
 
 		 2305 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  22.98 
 
 		 584 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  25.54 
 
 		 2310 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  24.69 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  23.89 
 
 		 382 aa  49.3  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  25 
 
 		 457 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  26.19 
 
 		 387 aa  48.9  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  30.94 
 
 		 827 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 		 440 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 556 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  25.55 
 
 		 358 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  23.64 
 
 		 461 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 472 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  34.21 
 
 		 363 aa  47.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.88 
 
 		 335 aa  47.8  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  21.59 
 
 		 332 aa  47.4  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  29.52 
 
 		 346 aa  47.4  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  23.6 
 
 		 436 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  21.91 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0138  hypothetical protein  28.37 
 
 		 749 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  31.58 
 
 		 421 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  22.22 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.06 
 
 		 365 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  26.85 
 
 		 391 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  26.8 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  21.39 
 
 		 1194 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  26.85 
 
 		 445 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  22.38 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  22.68 
 
 		 426 aa  45.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  27.91 
 
 		 410 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  22.5 
 
 		 539 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  24 
 
 		 630 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  31.33 
 
 		 399 aa  44.3  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  24.02 
 
 		 635 aa  44.3  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>