34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00790 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  100 
 
 
402 aa  828    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  38.72 
 
 
431 aa  274  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  35.1 
 
 
486 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  32.36 
 
 
438 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  32.64 
 
 
526 aa  187  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  30 
 
 
831 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  29.16 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  31.64 
 
 
458 aa  173  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  28.61 
 
 
368 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  34.5 
 
 
725 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  30.6 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  25.8 
 
 
827 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  29.63 
 
 
401 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  23.37 
 
 
393 aa  112  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  25.19 
 
 
409 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  22.75 
 
 
620 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56506  predicted protein  22.53 
 
 
594 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286813  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56510  predicted protein  23.17 
 
 
664 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  24.4 
 
 
498 aa  90.5  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  27.24 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01332  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  28.26 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_1372  predicted protein  26.64 
 
 
523 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192993  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61452  glucan 1,3-beta-glucosidase  26.94 
 
 
506 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243086  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  25.82 
 
 
601 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.6 
 
 
673 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 
573 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.91 
 
 
705 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.79 
 
 
468 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  25.46 
 
 
853 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  24.87 
 
 
869 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  22.71 
 
 
863 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  23.03 
 
 
847 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08947  Putative exo-beta-1,3-glucanase (GH5-family); member of the ScExg1-family (Eurofung)  23.81 
 
 
584 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.849577  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  24.41 
 
 
470 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>