29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1088 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  100 
 
 		 346 aa  717    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  27.97 
 
 		 393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  32.35 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  26.5 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  32.89 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  31.46 
 
 		 401 aa  121  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  29.72 
 
 		 486 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  29.03 
 
 		 431 aa  87.4  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  27.24 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  27.46 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  24.27 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  26.72 
 
 		 725 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  23.99 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  25.14 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  22.99 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  32.28 
 
 		 831 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  27.83 
 
 		 827 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  31.4 
 
 		 705 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  24.2 
 
 		 853 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  29.52 
 
 		 601 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 		 847 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  23.25 
 
 		 470 aa  46.2  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56506  predicted protein  20.72 
 
 		 594 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286813  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  21.2 
 
 		 620 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  20.78 
 
 		 863 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25.81 
 
 		 573 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.74 
 
 		 869 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92070  predicted protein  25.96 
 
 		 770 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>