21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56506 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_56506  predicted protein  100 
 
 
594 aa  1245    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.286813  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49610  exo-1,3-beta-glucosidase  52.06 
 
 
620 aa  546  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_56510  predicted protein  45.84 
 
 
664 aa  532  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  26.87 
 
 
431 aa  140  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  25.66 
 
 
438 aa  134  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  26.38 
 
 
486 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  25.05 
 
 
831 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  27.4 
 
 
827 aa  120  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  25.68 
 
 
458 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  25.65 
 
 
725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  22.53 
 
 
402 aa  101  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  22.27 
 
 
526 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  24.21 
 
 
368 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  23.42 
 
 
368 aa  97.4  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  22.57 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  25.33 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  24.14 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  20.86 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  20.22 
 
 
409 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  20.72 
 
 
346 aa  45.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  28.26 
 
 
705 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>