180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4284 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 705 aa  1444    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  49.41 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  49.75 
 
 		 853 aa  379  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  53.04 
 
 		 869 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  43.65 
 
 		 610 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 847 aa  132  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  45.57 
 
 		 673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  39.08 
 
 		 1167 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  27.2 
 
 		 470 aa  127  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  45.99 
 
 		 726 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  52.5 
 
 		 536 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  47.58 
 
 		 389 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  26.63 
 
 		 456 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  45.24 
 
 		 1132 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  50.83 
 
 		 383 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  46.67 
 
 		 948 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.89 
 
 		 673 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1024 aa  111  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.54 
 
 		 933 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  47.06 
 
 		 465 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  43.18 
 
 		 1391 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  47.11 
 
 		 982 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  43.28 
 
 		 884 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  44.72 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  35.43 
 
 		 503 aa  105  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 639 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  48.28 
 
 		 877 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  39.86 
 
 		 957 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  28.03 
 
 		 461 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  29.96 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  42.03 
 
 		 569 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  42.22 
 
 		 863 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  31.06 
 
 		 601 aa  100  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  31.01 
 
 		 481 aa  97.4  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  37.87 
 
 		 918 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  27.76 
 
 		 489 aa  94.7  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  32.73 
 
 		 1091 aa  93.6  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  33.78 
 
 		 550 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  28.57 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  29.95 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  24.7 
 
 		 590 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.33 
 
 		 1321 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.57 
 
 		 1338 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  39.06 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  29.03 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  27.94 
 
 		 573 aa  80.9  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  29.34 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  37.42 
 
 		 1707 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  34.2 
 
 		 827 aa  72.8  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  26.29 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  37.4 
 
 		 524 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  31.91 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  29.1 
 
 		 831 aa  71.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25.56 
 
 		 1115 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  29.66 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  37.69 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  36.5 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  32.77 
 
 		 1295 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  32.45 
 
 		 1799 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34.48 
 
 		 719 aa  70.1  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  30.04 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  42.55 
 
 		 801 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  34.25 
 
 		 823 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  36.09 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  35.45 
 
 		 930 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  32.9 
 
 		 954 aa  66.6  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  35.66 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  31.08 
 
 		 919 aa  65.1  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  34.19 
 
 		 630 aa  63.9  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  32.03 
 
 		 393 aa  63.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  37.62 
 
 		 819 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  34.34 
 
 		 972 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  34.68 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  30.28 
 
 		 802 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  37.62 
 
 		 870 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  31.82 
 
 		 951 aa  61.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  35.19 
 
 		 855 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.64 
 
 		 1356 aa  60.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.72 
 
 		 777 aa  60.8  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  33.98 
 
 		 798 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  25.91 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  29.19 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  29.58 
 
 		 1380 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  24.88 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.66 
 
 		 845 aa  58.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  35 
 
 		 604 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  27.03 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  33.96 
 
 		 840 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  30.61 
 
 		 1262 aa  57.4  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  24.53 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.29 
 
 		 786 aa  57.4  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  27.66 
 
 		 431 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  32.19 
 
 		 739 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  33.06 
 
 		 965 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  31.4 
 
 		 346 aa  56.6  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  31.53 
 
 		 1234 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>