148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2209 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 739 aa  1492    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0150  hypothetical protein  39.71 
 
 		 831 aa  201  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1087  hypothetical protein  42.18 
 
 		 375 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.344662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0882  hypothetical protein  39.78 
 
 		 282 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  42.16 
 
 		 1387 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  42.79 
 
 		 966 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39 
 
 		 840 aa  128  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.83 
 
 		 823 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.65 
 
 		 802 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  34.06 
 
 		 777 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  45.1 
 
 		 930 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  46.67 
 
 		 919 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  36.46 
 
 		 870 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  44.23 
 
 		 719 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  39.59 
 
 		 668 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  42.59 
 
 		 1234 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.84 
 
 		 819 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  37.19 
 
 		 1356 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  41.67 
 
 		 524 aa  115  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 387 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  42.86 
 
 		 954 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.76 
 
 		 845 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  41.71 
 
 		 1799 aa  114  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.26 
 
 		 786 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  56.57 
 
 		 391 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  70.59 
 
 		 294 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  46.92 
 
 		 1380 aa  111  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  54.35 
 
 		 869 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  36.97 
 
 		 875 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  45.1 
 
 		 1035 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  51.79 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  62.16 
 
 		 298 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  63.38 
 
 		 735 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  35.02 
 
 		 1732 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.87 
 
 		 3295 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.61 
 
 		 2554 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  40.97 
 
 		 982 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  64.1 
 
 		 522 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 		 468 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  56.47 
 
 		 958 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  64.29 
 
 		 930 aa  104  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  37.08 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  56 
 
 		 581 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  61.43 
 
 		 579 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  60.56 
 
 		 433 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  39.62 
 
 		 787 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  40 
 
 		 630 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  36.05 
 
 		 801 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  42.21 
 
 		 627 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  38.41 
 
 		 1262 aa  99  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  55 
 
 		 488 aa  98.2  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  46.96 
 
 		 676 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  61.43 
 
 		 848 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  55.71 
 
 		 749 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  36.88 
 
 		 855 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  53.33 
 
 		 361 aa  94.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  60.32 
 
 		 561 aa  94.4  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.15 
 
 		 933 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  54.17 
 
 		 389 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  53.42 
 
 		 390 aa  92  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  53.62 
 
 		 831 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  53.42 
 
 		 709 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1024 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.05 
 
 		 547 aa  88.6  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  38.71 
 
 		 403 aa  87.8  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  58.73 
 
 		 479 aa  87.8  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  32.72 
 
 		 1004 aa  87.4  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  58.57 
 
 		 343 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  31.98 
 
 		 1295 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  51.43 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  31.07 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  52.86 
 
 		 697 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  54.93 
 
 		 479 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  33.77 
 
 		 918 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  29.28 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  35.22 
 
 		 948 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  50.77 
 
 		 1056 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.14 
 
 		 1338 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.01 
 
 		 1321 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 1132 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  35.62 
 
 		 798 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.04 
 
 		 1707 aa  74.3  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  51.52 
 
 		 595 aa  74.3  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1205  hypothetical protein  26.13 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.62 
 
 		 569 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  39.76 
 
 		 883 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  45.59 
 
 		 884 aa  65.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  28 
 
 		 1167 aa  64.7  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  29.44 
 
 		 972 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  37.1 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  35.42 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 594 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  26.91 
 
 		 869 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  32.87 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  45.83 
 
 		 975 aa  60.1  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  41.18 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  29.08 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  30.46 
 
 		 705 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>