236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0652 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  100 
 
 		 569 aa  1141    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  46.53 
 
 		 279 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 		 642 aa  211  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  45.9 
 
 		 291 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 		 641 aa  211  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  47.97 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.37 
 
 		 627 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  42.51 
 
 		 610 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  46.77 
 
 		 282 aa  202  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.61 
 
 		 1290 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  46.4 
 
 		 289 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  40.85 
 
 		 1707 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  42.8 
 
 		 281 aa  193  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  46.18 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  46.28 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  44.22 
 
 		 283 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  37.74 
 
 		 673 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  45.34 
 
 		 389 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.67 
 
 		 288 aa  183  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.17 
 
 		 252 aa  180  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  41.29 
 
 		 1167 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  40.31 
 
 		 588 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  40.84 
 
 		 274 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.68 
 
 		 633 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  41.27 
 
 		 883 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  40.34 
 
 		 954 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  43.15 
 
 		 409 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  35.86 
 
 		 918 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  39.85 
 
 		 276 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  36.68 
 
 		 1391 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  38.65 
 
 		 286 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  41.55 
 
 		 752 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  37.05 
 
 		 1321 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  37.96 
 
 		 503 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 384 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.26 
 
 		 742 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  35.07 
 
 		 394 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  38.02 
 
 		 271 aa  144  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  37.6 
 
 		 301 aa  143  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  35.35 
 
 		 982 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  36.47 
 
 		 1028 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.57 
 
 		 1059 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  34.15 
 
 		 328 aa  133  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  52.24 
 
 		 550 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  36.68 
 
 		 877 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.67 
 
 		 863 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.94 
 
 		 819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.34 
 
 		 1338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.92 
 
 		 532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  46.53 
 
 		 884 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 260 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.7 
 
 		 1321 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  45.45 
 
 		 957 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  31.48 
 
 		 1234 aa  126  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  47.55 
 
 		 465 aa  126  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  54.46 
 
 		 536 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 		 541 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.32 
 
 		 1694 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.93 
 
 		 358 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  35.03 
 
 		 269 aa  123  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.65 
 
 		 912 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 		 694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.94 
 
 		 261 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  33.83 
 
 		 330 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.58 
 
 		 1332 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  31.34 
 
 		 1918 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.4 
 
 		 884 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  37.05 
 
 		 286 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.12 
 
 		 1441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.07 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  31.41 
 
 		 1262 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  34.48 
 
 		 238 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.37 
 
 		 306 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  30.53 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.77 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  48.59 
 
 		 802 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31 
 
 		 328 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  32.89 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  42.47 
 
 		 948 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  39.88 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  29.57 
 
 		 1799 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  46.72 
 
 		 1024 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 		 308 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  47.83 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  29.75 
 
 		 1035 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  46.48 
 
 		 819 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  44.93 
 
 		 845 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  46.43 
 
 		 1356 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  33.97 
 
 		 275 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  44.22 
 
 		 726 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  46.04 
 
 		 823 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  46.76 
 
 		 870 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  45.71 
 
 		 719 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  46.62 
 
 		 840 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  32.82 
 
 		 286 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  45 
 
 		 1380 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  30.94 
 
 		 313 aa  101  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>