121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4150 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  50.39 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  47.14 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  46.67 
 
 		 423 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  43.33 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  41.49 
 
 		 426 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  40.71 
 
 		 588 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.95 
 
 		 282 aa  161  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.52 
 
 		 633 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  39.58 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.75 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  36.76 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  37.65 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 		 642 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  35.27 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 		 641 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  35.11 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.8 
 
 		 627 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.99 
 
 		 1290 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.69 
 
 		 569 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.08 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.8 
 
 		 389 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  37.86 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.71 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  39.04 
 
 		 883 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  32.97 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  35.19 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  34.82 
 
 		 556 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  33.59 
 
 		 1028 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  36.29 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.21 
 
 		 503 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  37.75 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.07 
 
 		 742 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.9 
 
 		 884 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.48 
 
 		 1059 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.74 
 
 		 912 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.93 
 
 		 532 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  31.73 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.46 
 
 		 819 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  33.05 
 
 		 752 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  35.29 
 
 		 1441 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  35.2 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 1321 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.62 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.14 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.9 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.58 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  34.82 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.03 
 
 		 547 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.2 
 
 		 1332 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  31.18 
 
 		 469 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  28.98 
 
 		 1918 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  31.28 
 
 		 467 aa  99  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  38.86 
 
 		 427 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.48 
 
 		 815 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.17 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  31.02 
 
 		 464 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 694 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  30.93 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  26.55 
 
 		 405 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  28.23 
 
 		 238 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.57 
 
 		 1694 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  30.5 
 
 		 446 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  30.07 
 
 		 479 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.41 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  34.5 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  30.4 
 
 		 470 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.08 
 
 		 1007 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.22 
 
 		 639 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  32.32 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  26.24 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.62 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  25.95 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  29.52 
 
 		 479 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  29.23 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  26.84 
 
 		 318 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0557225 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  29.32 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  34.29 
 
 		 608 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  28.57 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  30.12 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  32.02 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  25.77 
 
 		 1707 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  30.92 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  30.04 
 
 		 999 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 		 907 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  31.98 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  26.36 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>