140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4931 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 286 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  58.26 
 
 		 276 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  52.46 
 
 		 503 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  49.82 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  51.25 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  54.47 
 
 		 301 aa  274  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  47.97 
 
 		 469 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  48.61 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  50.59 
 
 		 556 aa  232  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  50 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  46.38 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  45 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  41.67 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  45.34 
 
 		 641 aa  188  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  45.34 
 
 		 642 aa  188  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  43.7 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.6 
 
 		 627 aa  185  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  40.58 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  44.13 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  40.07 
 
 		 694 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  44.18 
 
 		 1321 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  43.62 
 
 		 426 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.71 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.39 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.68 
 
 		 633 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  40.49 
 
 		 883 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.93 
 
 		 884 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.4 
 
 		 547 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  44.3 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  41.04 
 
 		 588 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  39.16 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.36 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  43.22 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.81 
 
 		 532 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.57 
 
 		 1290 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  39.42 
 
 		 1918 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  40.44 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  38.89 
 
 		 1028 aa  159  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.2 
 
 		 912 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  38.34 
 
 		 569 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.16 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.21 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.04 
 
 		 1059 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  42.19 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.3 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.76 
 
 		 1694 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.56 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.94 
 
 		 742 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.36 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  39.53 
 
 		 1441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  35.23 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 		 384 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.07 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  34.48 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 1332 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.21 
 
 		 819 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  33.21 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  33.59 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 		 752 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  32.66 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  34.47 
 
 		 427 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  32.57 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  35 
 
 		 467 aa  106  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  32.97 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  34 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  27.8 
 
 		 263 aa  99  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 608 aa  92.4  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  31.8 
 
 		 446 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  24.91 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.65 
 
 		 1007 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 907 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  29.27 
 
 		 470 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  34.98 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  28.34 
 
 		 1707 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  32.84 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  28.82 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  30.14 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  27 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  29.04 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  27.67 
 
 		 479 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  28.68 
 
 		 479 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  30.43 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 686 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  28.99 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  29.64 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  29.18 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  28.42 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.74 
 
 		 722 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  30.71 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  27.21 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 		 815 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  28 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>