128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2108 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 
319 aa  664    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  32.33 
 
 
277 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.73 
 
 
532 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.46 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  30.1 
 
 
883 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  33.2 
 
 
263 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
1321 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  34 
 
 
286 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  32.33 
 
 
1918 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  29.5 
 
 
409 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 
694 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.83 
 
 
742 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.99 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.19 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  28.67 
 
 
276 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  28.63 
 
 
383 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.09 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  31.38 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.07 
 
 
328 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 
1332 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.3 
 
 
912 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  27.41 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.66 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  33.16 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.38 
 
 
884 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 
384 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  29.23 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 
556 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 
389 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.57 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.65 
 
 
627 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  27.47 
 
 
1028 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.15 
 
 
282 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  34.86 
 
 
503 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  28.31 
 
 
426 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 
686 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  35.67 
 
 
301 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.82 
 
 
330 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 
608 aa  85.9  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  29.39 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  27.04 
 
 
477 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 
752 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.67 
 
 
547 aa  83.2  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  27.55 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  25.58 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 
907 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.67 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.62 
 
 
633 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.81 
 
 
569 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  36.84 
 
 
238 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.96 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.55 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  31.58 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.57 
 
 
1290 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  26.28 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  27.37 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.97 
 
 
1694 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  29.69 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  27.27 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  29.28 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  26.18 
 
 
722 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  30.23 
 
 
842 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 
394 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  27 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  28.79 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  26.86 
 
 
691 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  28.28 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  27.94 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  28.41 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  26.03 
 
 
469 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  24.81 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  28.64 
 
 
261 aa  59.7  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  25.7 
 
 
539 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  30.11 
 
 
271 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  30.25 
 
 
446 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  27.47 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  26.82 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.12 
 
 
1007 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  21.86 
 
 
1059 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  28.06 
 
 
1707 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 
286 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.97 
 
 
819 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  25.48 
 
 
479 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  26.7 
 
 
288 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  25.65 
 
 
467 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  31.95 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0843  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 
284 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 
260 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  23.08 
 
 
1441 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>