235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7244 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  100 
 
 		 446 aa  900    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  57.14 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.42 
 
 		 815 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.86 
 
 		 639 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.52 
 
 		 1007 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  47.57 
 
 		 464 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  44.69 
 
 		 479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  47.52 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  46.32 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  44.56 
 
 		 999 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  46.15 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  36.7 
 
 		 426 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  42.14 
 
 		 539 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  34.95 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  63.27 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  67.72 
 
 		 732 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  67.52 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  65.79 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  59.56 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  47.93 
 
 		 890 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  58.73 
 
 		 1072 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  50.7 
 
 		 801 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.87 
 
 		 933 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.96 
 
 		 627 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  51.72 
 
 		 634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  32.36 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  50 
 
 		 1207 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  37.98 
 
 		 289 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  47.45 
 
 		 516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  48.44 
 
 		 803 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  47.66 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  48.46 
 
 		 373 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  29.08 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00031  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  42.76 
 
 		 490 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  46.77 
 
 		 603 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  33.98 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  41.46 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  32.63 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.12 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  41.89 
 
 		 801 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  45.08 
 
 		 492 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  46.09 
 
 		 451 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  30.07 
 
 		 274 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  38.89 
 
 		 548 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  44.62 
 
 		 1128 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  31.74 
 
 		 286 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.9 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  33.72 
 
 		 291 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.21 
 
 		 1290 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  33.2 
 
 		 283 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  45.16 
 
 		 472 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  36.57 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 		 752 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  38.89 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  30.42 
 
 		 301 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  43.4 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  31.97 
 
 		 588 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 556 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  41.41 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  28.53 
 
 		 503 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 709 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  34.07 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.35 
 
 		 1059 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  38.84 
 
 		 558 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  37.31 
 
 		 589 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  42.28 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  38.33 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  40.5 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 260 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.56 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  30.63 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  30.99 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.37 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  37.29 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  39.84 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  37.39 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  30.53 
 
 		 883 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  38.26 
 
 		 801 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  41.46 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28 
 
 		 1694 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.13 
 
 		 633 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  37.39 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.89 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  30.17 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.36 
 
 		 819 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.84 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.23 
 
 		 568 aa  80.5  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.51 
 
 		 627 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 469 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.24 
 
 		 912 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  28.57 
 
 		 276 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  28.48 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.02 
 
 		 742 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.91 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  28.26 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.67 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  30.31 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 1321 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.82 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>