215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4880 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  100 
 
 		 558 aa  1122    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  43.9 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  44.15 
 
 		 547 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  41.3 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  38.51 
 
 		 567 aa  339  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  44.1 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  45.11 
 
 		 407 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  36.15 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  43.24 
 
 		 604 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  38.62 
 
 		 408 aa  279  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  35.42 
 
 		 574 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  43.2 
 
 		 471 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  35.8 
 
 		 589 aa  276  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  41.07 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  40.26 
 
 		 399 aa  273  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  42.72 
 
 		 850 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  40.45 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  40.97 
 
 		 693 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  35.4 
 
 		 411 aa  246  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 636 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  33.16 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  34.98 
 
 		 631 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  36.36 
 
 		 727 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  33.42 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  62.94 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  59.85 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.29 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  29.95 
 
 		 532 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  30.28 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  53.85 
 
 		 368 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  31.2 
 
 		 434 aa  163  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  64.35 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  33.45 
 
 		 320 aa  161  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  60.66 
 
 		 498 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  57.89 
 
 		 801 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  60.33 
 
 		 472 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.73 
 
 		 583 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  61.16 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30 
 
 		 533 aa  155  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  48.82 
 
 		 490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  55.73 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  26.83 
 
 		 737 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  58.26 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  57.38 
 
 		 461 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  28.88 
 
 		 658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  27.23 
 
 		 640 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  60.83 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  58.2 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  56.1 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.14 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  27.88 
 
 		 677 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  58.26 
 
 		 468 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.94 
 
 		 445 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  30.64 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  54.92 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  54.92 
 
 		 497 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40 
 
 		 634 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  27.15 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  24.04 
 
 		 446 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  28.07 
 
 		 587 aa  117  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  48.2 
 
 		 801 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  23.86 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  48.74 
 
 		 803 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  48.31 
 
 		 492 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  44.27 
 
 		 516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  47.24 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  44.7 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  48.31 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  43.94 
 
 		 709 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  47.86 
 
 		 373 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  42.74 
 
 		 890 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.25 
 
 		 1072 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  26.72 
 
 		 612 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  40.87 
 
 		 426 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.98 
 
 		 933 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  41.03 
 
 		 414 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  24.08 
 
 		 453 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  42.74 
 
 		 452 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  39.5 
 
 		 1128 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  37.25 
 
 		 417 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.35 
 
 		 627 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  34.83 
 
 		 1207 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  39.74 
 
 		 384 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  41.53 
 
 		 732 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  43.44 
 
 		 165 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  38.84 
 
 		 446 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  31.01 
 
 		 642 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.67 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  25 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  25.47 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  32.39 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.38 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  24.88 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.07 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.29 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  31.69 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  36.09 
 
 		 1016 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  34.43 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  24.44 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>