109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3954 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 
318 aa  651    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  68.83 
 
 
464 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  67.54 
 
 
479 aa  424  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  71.43 
 
 
470 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  70.96 
 
 
479 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  53.57 
 
 
539 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  49.12 
 
 
469 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.39 
 
 
639 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.23 
 
 
1007 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  46.92 
 
 
999 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  45.79 
 
 
446 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  35.08 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.15 
 
 
815 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00031  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 
361 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  35.12 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  33.12 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.96 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  36.5 
 
 
283 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  34.19 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.57 
 
 
1290 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  33.11 
 
 
389 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  32.01 
 
 
641 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  32.01 
 
 
642 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  31.64 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.25 
 
 
627 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  33.7 
 
 
291 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  31.77 
 
 
281 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.38 
 
 
409 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.04 
 
 
261 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  33.47 
 
 
752 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.7 
 
 
1694 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.87 
 
 
633 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  30.24 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.55 
 
 
569 aa  96.3  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.15 
 
 
260 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  28.57 
 
 
883 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.45 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
1321 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  29.25 
 
 
276 aa  89.4  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  30.19 
 
 
503 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  28.52 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 
556 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.87 
 
 
819 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  29.1 
 
 
274 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  30.4 
 
 
1028 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.21 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.23 
 
 
588 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.74 
 
 
742 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  30.11 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  28.21 
 
 
1059 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  30.9 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.43 
 
 
532 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.69 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  30.36 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.88 
 
 
547 aa  76.6  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.76 
 
 
912 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.74 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.71 
 
 
884 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  30.39 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  27.9 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  29.44 
 
 
1332 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
469 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  27.72 
 
 
1918 aa  69.7  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.03 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.94 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.25 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  25.26 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  30.54 
 
 
238 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  26.06 
 
 
1707 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 
694 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  28.52 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  27.12 
 
 
269 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.83 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  25.82 
 
 
1441 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  25.81 
 
 
337 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 
449 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  25.78 
 
 
477 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  26.1 
 
 
722 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  23.78 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  25.54 
 
 
288 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  24.66 
 
 
313 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 
608 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2952  glycoside hydrolase family 16  30.65 
 
 
258 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123961  hitchhiker  0.0028074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
907 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  23.89 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  31.49 
 
 
427 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3867  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183762  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 
306 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  24.04 
 
 
275 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.97 
 
 
915 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  24.85 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  24.3 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>