121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0558 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
449 aa  926    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  65.17 
 
 
722 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  36.74 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.54 
 
 
252 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.74 
 
 
1290 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 
694 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 
556 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  28.85 
 
 
389 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 
752 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.88 
 
 
884 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.7 
 
 
633 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 
1321 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.39 
 
 
358 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  31.13 
 
 
279 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3726  glycosy hydrolase family protein  29.41 
 
 
287 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  32.18 
 
 
291 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  31.64 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.76 
 
 
912 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.24 
 
 
532 aa  98.2  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  30.51 
 
 
883 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  30.57 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 
641 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 
642 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  30.23 
 
 
281 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  27.05 
 
 
275 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  31.2 
 
 
274 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  31.13 
 
 
289 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  31.64 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 
301 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 
291 aa  91.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  28.86 
 
 
1059 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 
469 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.96 
 
 
569 aa  90.1  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.96 
 
 
819 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  30.86 
 
 
1028 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.54 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.87 
 
 
742 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  27.41 
 
 
286 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.02 
 
 
261 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  28.91 
 
 
283 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.46 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  30.34 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.04 
 
 
288 aa  84  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.21 
 
 
588 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.41 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.42 
 
 
1441 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.9 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  28.84 
 
 
503 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  28.07 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.17 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  26.84 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  25.57 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.8 
 
 
282 aa  79.7  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.07 
 
 
1694 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  30.71 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  25.74 
 
 
1918 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 
1332 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.61 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.55 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  26.28 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  29.39 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  25.93 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.25 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  25.45 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  29.96 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  28.34 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 
608 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  26.74 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  23.92 
 
 
842 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  28.17 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  29.13 
 
 
286 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 
907 aa  66.6  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  26.01 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  26.09 
 
 
477 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  26.41 
 
 
479 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  27.17 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  22.83 
 
 
288 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  27.76 
 
 
479 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  23.58 
 
 
1707 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  26.47 
 
 
295 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1119  endo-beta-galactosidase, GlcNAc-alpha-1,4-Gal-releasing  24.72 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.308798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 
260 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
686 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  25.38 
 
 
263 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 
320 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  25.79 
 
 
275 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  26.59 
 
 
628 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  23.05 
 
 
277 aa  57.4  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 
284 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  27.59 
 
 
486 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  26.76 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  24.29 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  25.5 
 
 
238 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  26.88 
 
 
329 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>