87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6178 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 329 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  56.58 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  39.6 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  30 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.35 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  29.41 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  25.81 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.8 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  27.07 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  24.32 
 
 		 883 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.29 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  26.69 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  26.97 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.89 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.05 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  28.51 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 694 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  27.78 
 
 		 1059 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.01 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.32 
 
 		 1290 aa  69.3  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  26.1 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  25.63 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  29.08 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  27.05 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.6 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  29.74 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  26.97 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  27.24 
 
 		 1028 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 642 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 641 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  26.92 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  24.72 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.97 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  25.19 
 
 		 1707 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  28.73 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  26.2 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.18 
 
 		 633 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.47 
 
 		 819 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.38 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  25.68 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.57 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.99 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  24.15 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  22.98 
 
 		 547 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.83 
 
 		 627 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 449 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.19 
 
 		 912 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.22 
 
 		 532 aa  52.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  25.6 
 
 		 1441 aa  52.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  22.98 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.51 
 
 		 1694 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  23.59 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.68 
 
 		 742 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.08 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 1332 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  23.67 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  23.72 
 
 		 1321 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  25 
 
 		 475 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  25 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  27.14 
 
 		 503 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  25.42 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  23.89 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  25.09 
 
 		 271 aa  49.3  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  25.59 
 
 		 722 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 752 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  26.92 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  22.82 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  26.51 
 
 		 1918 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  23.67 
 
 		 446 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 394 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  27.56 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  27.16 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.32 
 
 		 815 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  29.94 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  22.02 
 
 		 686 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  23.39 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.22 
 
 		 639 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>