62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2952 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2952  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 
258 aa  537  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123961  hitchhiker  0.0028074 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  24.5 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.81 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 
1321 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 
641 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 
642 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  27.31 
 
 
291 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  28.46 
 
 
383 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  24.04 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  29.23 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  28.91 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  26.13 
 
 
842 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
465 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  26.75 
 
 
288 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.13 
 
 
1694 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  25 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.17 
 
 
532 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 
907 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.69 
 
 
306 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 
694 aa  55.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.15 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  25.7 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  24.37 
 
 
409 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.62 
 
 
627 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.9 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.16 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.38 
 
 
475 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 
449 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  23.08 
 
 
883 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  22.43 
 
 
722 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.27 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  23.48 
 
 
1028 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 
320 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  29.93 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 
1332 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
608 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.35 
 
 
1290 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  29.93 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.17 
 
 
633 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.71 
 
 
328 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  24.41 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 
556 aa  48.5  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.91 
 
 
819 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.59 
 
 
912 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  31.9 
 
 
1441 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.41 
 
 
884 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  27.06 
 
 
539 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  23.97 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 
492 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  30.22 
 
 
477 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
752 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 
686 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  23.96 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  29.61 
 
 
467 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  31.13 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  22.74 
 
 
389 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>