133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7304 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  48.82 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  41.25 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.75 
 
 		 423 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  38.78 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.9 
 
 		 1290 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  38.27 
 
 		 383 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.92 
 
 		 426 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.14 
 
 		 389 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  38.43 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  34.39 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  38.91 
 
 		 291 aa  148  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  35.89 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.25 
 
 		 627 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  36.55 
 
 		 556 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 		 641 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 		 642 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  36.36 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  38.93 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  36.95 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.36 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 		 394 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.68 
 
 		 288 aa  131  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.84 
 
 		 742 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  32.28 
 
 		 588 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.88 
 
 		 1321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  35.8 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  34.69 
 
 		 503 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.51 
 
 		 819 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  30.92 
 
 		 883 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.32 
 
 		 532 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  33.46 
 
 		 409 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 		 1332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 469 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.26 
 
 		 633 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.9 
 
 		 1441 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.28 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.62 
 
 		 569 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  33.81 
 
 		 328 aa  118  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.91 
 
 		 884 aa  118  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 384 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  32.43 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  32.86 
 
 		 1918 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.54 
 
 		 330 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  33.33 
 
 		 1059 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.79 
 
 		 547 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.85 
 
 		 912 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  36.93 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.72 
 
 		 1694 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  34.6 
 
 		 470 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  34.56 
 
 		 479 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.03 
 
 		 315 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 		 752 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 427 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  34.75 
 
 		 479 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.82 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.37 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  31.1 
 
 		 318 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.65 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 		 291 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 		 694 aa  99  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  33.33 
 
 		 467 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.71 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  36.4 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.75 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 639 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  31.52 
 
 		 464 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  30.77 
 
 		 1028 aa  95.5  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  32.48 
 
 		 539 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  32.45 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  27.5 
 
 		 405 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  26.69 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 		 449 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.06 
 
 		 1007 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  32.35 
 
 		 469 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  31.62 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  27.92 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.26 
 
 		 815 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1119  endo-beta-galactosidase, GlcNAc-alpha-1,4-Gal-releasing  28.03 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.308798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 608 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  29.33 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  35.2 
 
 		 686 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  27.96 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29.91 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  29.38 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  26.96 
 
 		 722 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  30.93 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  28.16 
 
 		 1707 aa  72.8  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 		 465 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  33.14 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>