72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0298 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  78.75 
 
 
287 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  78.8 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  78.8 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  78.8 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  58.2 
 
 
294 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.72 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  28.78 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
1332 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  25.94 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  28.99 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  27.89 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  29.13 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.86 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  25.43 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.25 
 
 
1441 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
556 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  29.3 
 
 
426 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  29.27 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.24 
 
 
819 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  28 
 
 
883 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  29.25 
 
 
409 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  28.35 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  28.69 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  29.65 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  25.74 
 
 
330 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  25.2 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.23 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  28.32 
 
 
1059 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.25 
 
 
547 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.43 
 
 
627 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  25.46 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  25.86 
 
 
479 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  27.34 
 
 
470 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  25.17 
 
 
503 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  26.36 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 
1321 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 
427 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  25.67 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.83 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  25.1 
 
 
464 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  30.21 
 
 
383 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 
469 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  27.49 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  26.67 
 
 
286 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.98 
 
 
633 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  30.99 
 
 
475 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  26.16 
 
 
479 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 
449 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 
465 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.68 
 
 
1290 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  25.98 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  29.94 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  26.32 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  26.18 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  28.28 
 
 
281 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  28.12 
 
 
691 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  25.95 
 
 
569 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.84 
 
 
1694 aa  45.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
608 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 
752 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  27.43 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  27.32 
 
 
389 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  26.67 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>