142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2434 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
556 aa  1143    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.11 
 
 
547 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  50.81 
 
 
274 aa  233  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  50.59 
 
 
286 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  47.77 
 
 
276 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  48.32 
 
 
286 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  45.67 
 
 
279 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  48.13 
 
 
503 aa  210  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  43.13 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  45.06 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  46.44 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  46.22 
 
 
291 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  43.92 
 
 
330 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  46.35 
 
 
389 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  44.58 
 
 
301 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  45.64 
 
 
289 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.5 
 
 
1290 aa  193  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  42.97 
 
 
281 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  41.77 
 
 
641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  41.77 
 
 
642 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.83 
 
 
252 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  42.91 
 
 
283 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  45.19 
 
 
409 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  43.93 
 
 
238 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.57 
 
 
633 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  42.08 
 
 
426 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.11 
 
 
627 aa  166  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  37.69 
 
 
883 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 
1321 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  39.01 
 
 
328 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38 
 
 
282 aa  159  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  39.84 
 
 
384 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.73 
 
 
288 aa  158  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.75 
 
 
315 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  38.04 
 
 
588 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.37 
 
 
358 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 
694 aa  154  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.59 
 
 
532 aa  153  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  33.46 
 
 
1059 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.6 
 
 
1694 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.46 
 
 
306 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.4 
 
 
742 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  35.53 
 
 
286 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 
291 aa  147  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  39.92 
 
 
1332 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.55 
 
 
261 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.52 
 
 
884 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.56 
 
 
328 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  37.46 
 
 
1918 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  34.33 
 
 
313 aa  141  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.18 
 
 
569 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  35.74 
 
 
275 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.45 
 
 
819 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.36 
 
 
912 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.77 
 
 
290 aa  134  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 
752 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  36.33 
 
 
1028 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  36.32 
 
 
271 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.8 
 
 
1441 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  34.8 
 
 
405 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  39.27 
 
 
467 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 
346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  35.53 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  34.52 
 
 
479 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 
449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  32.72 
 
 
470 aa  113  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  35.61 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.1 
 
 
722 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 
260 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  33.88 
 
 
269 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
427 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
465 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  32.09 
 
 
539 aa  98.2  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.65 
 
 
639 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  28.85 
 
 
475 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 
306 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  30.96 
 
 
469 aa  94.4  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  27.96 
 
 
1707 aa  91.3  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  27.24 
 
 
277 aa  91.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  31.66 
 
 
446 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  30.41 
 
 
295 aa  90.5  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.14 
 
 
1007 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  30.43 
 
 
334 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  31.61 
 
 
319 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  28.33 
 
 
263 aa  88.6  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  30.22 
 
 
318 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 
608 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 
320 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  27.68 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  27.57 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  30.21 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 
907 aa  78.2  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  29.65 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  32.99 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  30.85 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 
686 aa  77  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  27.53 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>