123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54973 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  100 
 
 		 467 aa  937    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.88 
 
 		 819 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  35.69 
 
 		 1059 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40 
 
 		 633 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  35.55 
 
 		 1441 aa  166  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  40.72 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  42.13 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  35.22 
 
 		 389 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  34.23 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  38.74 
 
 		 556 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.34 
 
 		 627 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  35.65 
 
 		 279 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 		 642 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 		 641 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  35.06 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  37.73 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.43 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.58 
 
 		 252 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.48 
 
 		 1290 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  30.31 
 
 		 384 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  32.89 
 
 		 281 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  34.39 
 
 		 289 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 752 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.91 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  33.19 
 
 		 569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  27.98 
 
 		 1707 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  32.94 
 
 		 286 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  35.83 
 
 		 883 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.33 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  33.48 
 
 		 1028 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  32.55 
 
 		 276 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.93 
 
 		 288 aa  103  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 		 1321 aa  103  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  31.32 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  33.47 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.62 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.2 
 
 		 1332 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  34.6 
 
 		 286 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.45 
 
 		 912 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 261 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  31.66 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  28.91 
 
 		 275 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.23 
 
 		 1694 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  30.96 
 
 		 286 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.6 
 
 		 306 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.98 
 
 		 884 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.4 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  29.11 
 
 		 313 aa  94.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  31.14 
 
 		 283 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.1 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  27.67 
 
 		 330 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.92 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  32 
 
 		 479 aa  90.1  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  30.83 
 
 		 539 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  31.71 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  29.8 
 
 		 328 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 291 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  31.5 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  28.4 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  31.2 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.58 
 
 		 588 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 694 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  33.47 
 
 		 260 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.14 
 
 		 742 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  30.53 
 
 		 1918 aa  80.1  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  28.51 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  26.64 
 
 		 722 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  29.73 
 
 		 269 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.61 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  31.52 
 
 		 238 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  30.62 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.14 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  30.04 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31 
 
 		 1007 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  27.53 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  31.79 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  26.01 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 915 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.94 
 
 		 815 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 320 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 686 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  27.44 
 
 		 295 aa  55.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  25.65 
 
 		 319 aa  55.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  25.51 
 
 		 288 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  32.87 
 
 		 999 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  25.14 
 
 		 275 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_006686  CND06130  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 		 599 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.533369  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 284 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06160  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 588 aa  50.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  32.79 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.89 
 
 		 3210 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>