More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2927 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  100 
 
 		 1441 aa  2951    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.44 
 
 		 819 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  41.06 
 
 		 1059 aa  335  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1445  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.21 
 
 		 473 aa  270  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.71 
 
 		 674 aa  210  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  46 
 
 		 1581 aa  209  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  45.1 
 
 		 850 aa  207  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.01 
 
 		 962 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  45.49 
 
 		 987 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.44 
 
 		 581 aa  202  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 752 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  31.2 
 
 		 1707 aa  191  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3033  hypothetical protein  40.14 
 
 		 292 aa  189  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0401759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.36 
 
 		 1158 aa  188  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.09 
 
 		 578 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.88 
 
 		 815 aa  184  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3166  hypothetical protein  39.57 
 
 		 320 aa  184  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  41.09 
 
 		 4013 aa  178  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  34.26 
 
 		 467 aa  178  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  43.2 
 
 		 291 aa  178  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  38.6 
 
 		 588 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  38.97 
 
 		 276 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  40 
 
 		 383 aa  165  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.55 
 
 		 915 aa  164  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  37.24 
 
 		 279 aa  162  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  37.33 
 
 		 274 aa  161  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  38.69 
 
 		 409 aa  161  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.31 
 
 		 1564 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  39.93 
 
 		 301 aa  157  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.73 
 
 		 389 aa  154  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  39.53 
 
 		 286 aa  151  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.8 
 
 		 633 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  39.85 
 
 		 283 aa  146  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  39.83 
 
 		 999 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  35.5 
 
 		 328 aa  144  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  34.7 
 
 		 503 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.41 
 
 		 756 aa  143  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.55 
 
 		 288 aa  141  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  34.8 
 
 		 556 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.61 
 
 		 953 aa  140  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 642 aa  139  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 641 aa  138  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  37.92 
 
 		 289 aa  138  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.91 
 
 		 1362 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.4 
 
 		 755 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.69 
 
 		 358 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.56 
 
 		 532 aa  137  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.44 
 
 		 306 aa  137  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  38.58 
 
 		 423 aa  137  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.75 
 
 		 252 aa  136  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.86 
 
 		 547 aa  135  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.74 
 
 		 1290 aa  135  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  49.19 
 
 		 392 aa  135  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35.63 
 
 		 426 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  50.77 
 
 		 1103 aa  134  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 		 694 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.77 
 
 		 315 aa  134  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 		 1321 aa  134  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  36.15 
 
 		 281 aa  133  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  48.41 
 
 		 1070 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.22 
 
 		 627 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  36.74 
 
 		 1028 aa  132  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  49.61 
 
 		 433 aa  132  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.43 
 
 		 282 aa  131  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  37.05 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.7 
 
 		 884 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 		 291 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.51 
 
 		 261 aa  128  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 469 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  33.82 
 
 		 330 aa  127  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  48 
 
 		 637 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  32.68 
 
 		 883 aa  127  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.2 
 
 		 1007 aa  127  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  52 
 
 		 571 aa  126  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.26 
 
 		 569 aa  125  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 		 384 aa  125  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.92 
 
 		 912 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  50.79 
 
 		 452 aa  122  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 929 aa  121  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.32 
 
 		 984 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.82 
 
 		 722 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 1694 aa  119  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  50.81 
 
 		 449 aa  118  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  32.73 
 
 		 1918 aa  118  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.41 
 
 		 940 aa  118  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 1332 aa  116  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  37.82 
 
 		 558 aa  115  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 639 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  47.24 
 
 		 801 aa  113  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  46.56 
 
 		 578 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  33.59 
 
 		 1028 aa  110  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  32.8 
 
 		 238 aa  110  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  37.1 
 
 		 271 aa  109  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.28 
 
 		 742 aa  108  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.4 
 
 		 971 aa  108  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  33.45 
 
 		 286 aa  108  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.18 
 
 		 290 aa  107  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  46.83 
 
 		 1059 aa  108  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.4 
 
 		 1117 aa  106  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>