134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3396 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  885    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  51.6 
 
 
449 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  66.67 
 
 
588 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  59.75 
 
 
987 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  62.82 
 
 
674 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  71.43 
 
 
962 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  67.65 
 
 
940 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  56.52 
 
 
581 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  55.56 
 
 
850 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.2 
 
 
755 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.78 
 
 
1007 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.14 
 
 
722 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.8 
 
 
578 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  53.37 
 
 
571 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.92 
 
 
815 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.37 
 
 
1158 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  61.63 
 
 
999 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.92 
 
 
639 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  50.62 
 
 
752 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3637  hypothetical protein  32.79 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000800589  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  49.61 
 
 
637 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.08 
 
 
756 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  56 
 
 
953 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  53.6 
 
 
392 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.91 
 
 
1321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  49.61 
 
 
1441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4151  hypothetical protein  33.96 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4237  hypothetical protein  33.45 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.58 
 
 
929 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  52.24 
 
 
452 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3980  putative periplasmic or exported protein  31.03 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0565  hypothetical protein  32.47 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138498  normal  0.211579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.17 
 
 
819 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  50.39 
 
 
4013 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  57.39 
 
 
1338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4754  Domain of unknown function DUF1996  35.19 
 
 
347 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 
578 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  46.76 
 
 
801 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  44.44 
 
 
1581 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3053  hypothetical protein  35.27 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  49.15 
 
 
1103 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  40.28 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  43.2 
 
 
732 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  51.54 
 
 
1059 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.87 
 
 
1564 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 
1332 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  45.97 
 
 
1070 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1731  hypothetical protein  33.08 
 
 
458 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00571907  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.33 
 
 
915 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.1 
 
 
471 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.54 
 
 
971 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.77 
 
 
1117 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  40.83 
 
 
879 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  45.38 
 
 
1028 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5371  hypothetical protein  30.59 
 
 
303 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06780  transmembrane receptor, putative  33.07 
 
 
902 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.51 
 
 
480 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.16 
 
 
1362 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  47.76 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.76 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  40.31 
 
 
1059 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.16 
 
 
984 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  50.72 
 
 
470 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.78 
 
 
1139 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.06 
 
 
729 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04570  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 
607 aa  95.9  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4655  hypothetical protein  28.26 
 
 
466 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.62 
 
 
695 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4564  hypothetical protein  27.9 
 
 
466 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4572  hypothetical protein  27.9 
 
 
466 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07870  WSC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11970)  30.52 
 
 
470 aa  93.2  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.691953 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4704  hypothetical protein  27.54 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08167  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 
507 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622525  normal  0.47594 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01807  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02100)  33.61 
 
 
331 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.504359 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00700  conserved hypothetical protein  32.16 
 
 
1778 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.92 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.92 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  47.69 
 
 
475 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.38 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02000  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 
532 aa  83.6  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.65 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01570  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 
568 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.43 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  31.43 
 
 
1471 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.83 
 
 
722 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  41.89 
 
 
1200 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.42 
 
 
929 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.91 
 
 
820 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.41 
 
 
1060 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 
1184 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.62 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  35.04 
 
 
899 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.56 
 
 
1038 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.83 
 
 
112 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  36.72 
 
 
644 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.59 
 
 
986 aa  63.5  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.88 
 
 
795 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.95 
 
 
1448 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  27.52 
 
 
2117 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.13 
 
 
1109 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>