21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3980 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3980  putative periplasmic or exported protein  100 
 
 
464 aa  970    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4572  hypothetical protein  46.42 
 
 
466 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4655  hypothetical protein  46.85 
 
 
466 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4704  hypothetical protein  46.42 
 
 
466 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4564  hypothetical protein  46.2 
 
 
466 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4151  hypothetical protein  39.5 
 
 
440 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0565  hypothetical protein  37.7 
 
 
441 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138498  normal  0.211579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4237  hypothetical protein  35.59 
 
 
476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  29.93 
 
 
449 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  31.03 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3637  hypothetical protein  25.5 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000800589  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4754  Domain of unknown function DUF1996  28.02 
 
 
347 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5371  hypothetical protein  28.51 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1731  hypothetical protein  25.47 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00571907  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00700  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
1778 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01807  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02100)  25.1 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.504359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3053  hypothetical protein  26.49 
 
 
457 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180302  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01570  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
568 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06780  transmembrane receptor, putative  25.3 
 
 
902 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295195  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04570  conserved hypothetical protein  23.72 
 
 
607 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07870  WSC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11970)  22.09 
 
 
470 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.691953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>