23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4151 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0565  hypothetical protein  79.82 
 
 
441 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138498  normal  0.211579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4151  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3980  putative periplasmic or exported protein  39.5 
 
 
464 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4237  hypothetical protein  37 
 
 
476 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4655  hypothetical protein  37.15 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4704  hypothetical protein  37.53 
 
 
466 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4572  hypothetical protein  37.53 
 
 
466 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4564  hypothetical protein  37.3 
 
 
466 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  33.96 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  31.6 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4754  Domain of unknown function DUF1996  32.06 
 
 
347 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00700  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 
1778 aa  91.7  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3637  hypothetical protein  26.8 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000800589  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06780  transmembrane receptor, putative  27.1 
 
 
902 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1731  hypothetical protein  25.7 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00571907  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07870  WSC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11970)  30.04 
 
 
470 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.691953 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04570  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3053  hypothetical protein  25.96 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180302  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02000  conserved hypothetical protein  25.34 
 
 
532 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08167  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 
507 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622525  normal  0.47594 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01807  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02100)  24.07 
 
 
331 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.504359 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01570  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 
568 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5371  hypothetical protein  25.45 
 
 
303 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>