19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5371 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5371  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3053  hypothetical protein  50.57 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1731  hypothetical protein  46.23 
 
 		 458 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00571907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  29.96 
 
 		 449 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  30.59 
 
 		 433 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4754  Domain of unknown function DUF1996  29.7 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3637  hypothetical protein  28.45 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000800589  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3980  putative periplasmic or exported protein  28.51 
 
 		 464 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4237  hypothetical protein  27.13 
 
 		 476 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4655  hypothetical protein  26.48 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4572  hypothetical protein  26.48 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4564  hypothetical protein  26.48 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4704  hypothetical protein  26.01 
 
 		 466 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0565  hypothetical protein  28.02 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138498  normal  0.211579 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07870  WSC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11970)  26.88 
 
 		 470 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.691953 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04570  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 607 aa  49.3  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4151  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00700  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 1778 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08167  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 507 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622525  normal  0.47594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>