23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4754 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4754  Domain of unknown function DUF1996  100 
 
 		 347 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  33.22 
 
 		 449 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  34.48 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3637  hypothetical protein  31.08 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000800589  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00700  conserved hypothetical protein  32.2 
 
 		 1778 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0565  hypothetical protein  31.56 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138498  normal  0.211579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4151  hypothetical protein  32.06 
 
 		 440 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06780  transmembrane receptor, putative  28.21 
 
 		 902 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3980  putative periplasmic or exported protein  28.02 
 
 		 464 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4572  hypothetical protein  27.38 
 
 		 466 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4704  hypothetical protein  27.38 
 
 		 466 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4564  hypothetical protein  27.38 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4655  hypothetical protein  27.38 
 
 		 466 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4237  hypothetical protein  29.32 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5371  hypothetical protein  29.7 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04570  conserved hypothetical protein  28.52 
 
 		 607 aa  79.3  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07870  WSC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11970)  28.33 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.691953 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08167  conserved hypothetical protein  26.3 
 
 		 507 aa  69.3  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622525  normal  0.47594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1731  hypothetical protein  27.24 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00571907  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01807  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02100)  35.2 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.504359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3053  hypothetical protein  27.39 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180302  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02000  conserved hypothetical protein  24.58 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01570  conserved hypothetical protein  23.79 
 
 		 568 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>