21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4564 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4704  hypothetical protein  98.5 
 
 		 466 aa  969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4572  hypothetical protein  98.93 
 
 		 466 aa  972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4564  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  980    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4655  hypothetical protein  98.28 
 
 		 466 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3980  putative periplasmic or exported protein  46.2 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4151  hypothetical protein  37.3 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0565  hypothetical protein  36.36 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138498  normal  0.211579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 476 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  30.8 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  27.9 
 
 		 433 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4754  Domain of unknown function DUF1996  27.38 
 
 		 347 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3637  hypothetical protein  23.85 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000800589  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00700  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 1778 aa  66.6  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06780  transmembrane receptor, putative  22.18 
 
 		 902 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5371  hypothetical protein  26.48 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01807  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02100)  23.85 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.504359 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07870  WSC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11970)  27.17 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.691953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1731  hypothetical protein  23.51 
 
 		 458 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00571907  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04570  conserved hypothetical protein  25.21 
 
 		 607 aa  54.3  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3053  hypothetical protein  25.35 
 
 		 457 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180302  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01570  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 		 568 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>