90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7141 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
538 aa  1068    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0761  hypothetical protein  52.32 
 
 
363 aa  312  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28530  hypothetical protein  38.36 
 
 
364 aa  212  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0528408  normal  0.0603049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7283  hypothetical protein  36.31 
 
 
377 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3238  hypothetical protein  33.77 
 
 
652 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359216  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2261  hypothetical protein  32.09 
 
 
832 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000443628  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 
953 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2985  hypothetical protein  31.74 
 
 
667 aa  94  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000400495  hitchhiker  0.00618409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  42.06 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  40 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  36.43 
 
 
637 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  40.46 
 
 
999 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  40.74 
 
 
987 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 
756 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.84 
 
 
1321 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  40.49 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  36.05 
 
 
571 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  31.67 
 
 
850 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  37.93 
 
 
1581 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  34.29 
 
 
732 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.8 
 
 
674 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.73 
 
 
581 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.09 
 
 
755 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.98 
 
 
1007 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  38.69 
 
 
578 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  38.01 
 
 
588 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.82 
 
 
578 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.41 
 
 
962 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  36.51 
 
 
1070 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.92 
 
 
1441 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.07 
 
 
729 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  26.7 
 
 
1471 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.82 
 
 
929 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.61 
 
 
971 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.5 
 
 
940 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.24 
 
 
815 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.39 
 
 
915 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  40.31 
 
 
1059 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  35.94 
 
 
4013 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.55 
 
 
1158 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  27.91 
 
 
1059 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.9 
 
 
722 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  34.78 
 
 
1103 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.53 
 
 
1109 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.59 
 
 
819 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 
752 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.41 
 
 
1117 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.35 
 
 
695 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  30.05 
 
 
1338 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  31.78 
 
 
558 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  30.6 
 
 
452 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.3 
 
 
1564 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.27 
 
 
1060 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  29.63 
 
 
879 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2044  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.97 
 
 
367 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.039257  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.71 
 
 
639 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  32.16 
 
 
1200 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.68 
 
 
1362 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.5 
 
 
1139 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.11 
 
 
984 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  27.35 
 
 
1061 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.87 
 
 
801 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.84 
 
 
1448 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.53 
 
 
478 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.21 
 
 
820 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  29.44 
 
 
2117 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  33.93 
 
 
475 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.65 
 
 
471 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
1332 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2680  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.78 
 
 
1055 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.434706  normal  0.896202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32 
 
 
858 aa  51.6  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.78 
 
 
472 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00883  discoidin domain protein  36.78 
 
 
1044 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0432744  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.78 
 
 
472 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  34.62 
 
 
1028 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.1 
 
 
929 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.86 
 
 
1212 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0482  hypothetical protein  40.68 
 
 
156 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.16 
 
 
470 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.14 
 
 
1001 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  29.71 
 
 
470 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  30.83 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.83 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.08 
 
 
480 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.16 
 
 
470 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  28.29 
 
 
1213 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
1184 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.98 
 
 
795 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  48.72 
 
 
928 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  36.21 
 
 
457 aa  43.9  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>