91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0553 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  100 
 
 		 1061 aa  2126    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00883  discoidin domain protein  39.67 
 
 		 1044 aa  733    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0432744  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1547  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.53 
 
 		 1050 aa  725    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2680  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.52 
 
 		 1055 aa  741    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.434706  normal  0.896202 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1604  hypothetical protein  39.62 
 
 		 1050 aa  727    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.88 
 
 		 1038 aa  366  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1988  hypothetical protein  24.5 
 
 		 725 aa  100  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2127  hypothetical protein  25.21 
 
 		 752 aa  92  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.655892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0789  hypothetical protein  27.33 
 
 		 765 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  33.6 
 
 		 1103 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.59 
 
 		 984 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.11 
 
 		 971 aa  74.7  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.43 
 
 		 1441 aa  73.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  35.54 
 
 		 637 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  34.96 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.68 
 
 		 953 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.29 
 
 		 1158 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 752 aa  65.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.97 
 
 		 674 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  31.15 
 
 		 1070 aa  63.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  34.15 
 
 		 850 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1186  hypothetical protein  25.97 
 
 		 757 aa  63.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  32.52 
 
 		 571 aa  62.4  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.8 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.52 
 
 		 1117 aa  61.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.75 
 
 		 756 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.97 
 
 		 962 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.48 
 
 		 478 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  30.77 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  32.54 
 
 		 999 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  32.93 
 
 		 1471 aa  58.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  33.07 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.19 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  29.85 
 
 		 558 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  32.28 
 
 		 1059 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  29.84 
 
 		 1581 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 755 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  31.29 
 
 		 433 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  31.45 
 
 		 987 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  24.66 
 
 		 621 aa  57  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.26 
 
 		 639 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.48 
 
 		 1338 aa  55.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  31.45 
 
 		 452 aa  55.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.06 
 
 		 819 aa  54.7  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.36 
 
 		 929 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  26.04 
 
 		 801 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.79 
 
 		 815 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.86 
 
 		 472 aa  53.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.56 
 
 		 1362 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.86 
 
 		 472 aa  53.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.06 
 
 		 940 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.56 
 
 		 1007 aa  52  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.18 
 
 		 1139 aa  51.6  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  21.83 
 
 		 610 aa  50.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.27 
 
 		 1321 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  34.68 
 
 		 449 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  29.51 
 
 		 557 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.51 
 
 		 722 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.17 
 
 		 1564 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  25.29 
 
 		 670 aa  50.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  27.33 
 
 		 768 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.12 
 
 		 480 aa  49.3  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  28.12 
 
 		 487 aa  49.3  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.12 
 
 		 487 aa  49.3  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.55 
 
 		 1264 aa  48.5  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.35 
 
 		 538 aa  48.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.23 
 
 		 915 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  30 
 
 		 1135 aa  48.1  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.69 
 
 		 929 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.31 
 
 		 986 aa  47.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  22.55 
 
 		 640 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  23.08 
 
 		 660 aa  47  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.19 
 
 		 1088 aa  47.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.1 
 
 		 578 aa  47.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  26.56 
 
 		 470 aa  46.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.83 
 
 		 470 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.89 
 
 		 581 aa  46.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  19.57 
 
 		 621 aa  46.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.83 
 
 		 470 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.79 
 
 		 644 aa  46.2  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  24.56 
 
 		 899 aa  45.8  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  21.98 
 
 		 2375 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  29.41 
 
 		 588 aa  45.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 		 4013 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.45 
 
 		 1246 aa  45.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  21.62 
 
 		 621 aa  45.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.78 
 
 		 644 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.89 
 
 		 820 aa  44.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  26.55 
 
 		 627 aa  44.7  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>