34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3519 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 
640 aa  1335    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.18 
 
 
576 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.11 
 
 
593 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.84 
 
 
616 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 
506 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.81 
 
 
344 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.51 
 
 
346 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  28.77 
 
 
319 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31 
 
 
367 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  27.95 
 
 
850 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 
319 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.8 
 
 
346 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.86 
 
 
385 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
325 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  32 
 
 
330 aa  51.6  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.52 
 
 
986 aa  50.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  29.36 
 
 
768 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 
752 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  23.53 
 
 
306 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.17 
 
 
315 aa  48.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  22.55 
 
 
1061 aa  47.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  31.86 
 
 
732 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  20.27 
 
 
855 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  26.72 
 
 
2095 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.98 
 
 
984 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  28.71 
 
 
818 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.19 
 
 
383 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  23.75 
 
 
571 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.17 
 
 
674 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  25.45 
 
 
384 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
326 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.46 
 
 
962 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.75 
 
 
577 aa  43.9  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  25.86 
 
 
2095 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>