106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5087 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  70.86 
 
 		 475 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  90 
 
 		 470 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  100 
 
 		 487 aa  985    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  90.43 
 
 		 470 aa  841    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 		 487 aa  985    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  86.62 
 
 		 471 aa  831    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  99.16 
 
 		 480 aa  962    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  90.64 
 
 		 470 aa  843    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.78 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.78 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17510  hypothetical protein  43.41 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1520  hypothetical protein  43.41 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  54.35 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  52.94 
 
 		 571 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  52.76 
 
 		 987 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.21 
 
 		 674 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.68 
 
 		 962 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.17 
 
 		 1158 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.71 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  49.28 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  48.55 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  51.45 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.44 
 
 		 815 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.18 
 
 		 722 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.36 
 
 		 953 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.76 
 
 		 729 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.74 
 
 		 940 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  43.18 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  45.32 
 
 		 850 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.27 
 
 		 755 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  51.13 
 
 		 999 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  42.97 
 
 		 637 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.61 
 
 		 1007 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.4 
 
 		 929 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.41 
 
 		 578 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 		 578 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.31 
 
 		 756 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.57 
 
 		 581 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.51 
 
 		 1321 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  49.11 
 
 		 1338 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  37.31 
 
 		 1059 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  41.01 
 
 		 752 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  41.94 
 
 		 801 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.28 
 
 		 1117 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  43.08 
 
 		 1441 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  40.74 
 
 		 1070 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  39.53 
 
 		 879 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  37.57 
 
 		 1581 aa  83.6  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  43.22 
 
 		 1028 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.22 
 
 		 971 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.35 
 
 		 984 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.62 
 
 		 915 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.15 
 
 		 819 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  36.84 
 
 		 1471 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.51 
 
 		 1564 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.97 
 
 		 1139 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  39.42 
 
 		 1103 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  35.11 
 
 		 732 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  38.46 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  37.78 
 
 		 1332 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  41.61 
 
 		 1059 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.77 
 
 		 722 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  33.83 
 
 		 2117 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 1184 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.85 
 
 		 4013 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.31 
 
 		 929 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.85 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.66 
 
 		 1362 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40 
 
 		 695 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  28.12 
 
 		 1061 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  32 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.76 
 
 		 1038 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  30.77 
 
 		 912 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  35.29 
 
 		 818 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.32 
 
 		 1448 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.84 
 
 		 820 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  26.11 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1157  hypothetical protein  41.82 
 
 		 151 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  33.93 
 
 		 644 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  31.25 
 
 		 1439 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.16 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.89 
 
 		 112 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30.26 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  31.3 
 
 		 768 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.26 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  25.73 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  25.73 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.45 
 
 		 1109 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.02 
 
 		 1001 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.14 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.3 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  23.42 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  31.67 
 
 		 899 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.73 
 
 		 933 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.38 
 
 		 1060 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  33.71 
 
 		 348 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  30.34 
 
 		 927 aa  45.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.14 
 
 		 1212 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  30.97 
 
 		 552 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>