87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3709 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  100 
 
 		 818 aa  1690    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  42.4 
 
 		 768 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  52.08 
 
 		 731 aa  154  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.41 
 
 		 541 aa  146  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  57.02 
 
 		 912 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  56.3 
 
 		 873 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  48.09 
 
 		 748 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 524 aa  99  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  41.04 
 
 		 674 aa  98.6  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.75 
 
 		 1246 aa  97.4  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  41.53 
 
 		 552 aa  95.5  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.23 
 
 		 1390 aa  87.4  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  39.69 
 
 		 1171 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 		 752 aa  81.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25537  predicted protein  33.33 
 
 		 2136 aa  79.7  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0834467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.98 
 
 		 1158 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.05 
 
 		 778 aa  75.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.08 
 
 		 962 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  32 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.94 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  31.94 
 
 		 159 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.21 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  34.48 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.83 
 
 		 1362 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  33.92 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.48 
 
 		 1448 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.42 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  29.24 
 
 		 987 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.93 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.93 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.49 
 
 		 674 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  49.15 
 
 		 430 aa  62  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  47.69 
 
 		 128 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  28.99 
 
 		 1107 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  32.17 
 
 		 897 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.11 
 
 		 929 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3428  hypothetical protein  34.65 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660009  hitchhiker  0.0000342661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  30.72 
 
 		 461 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  28.52 
 
 		 850 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  40.35 
 
 		 763 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  40 
 
 		 1577 aa  54.3  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.81 
 
 		 915 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  30.22 
 
 		 465 aa  53.5  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 644 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.91 
 
 		 1321 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.18 
 
 		 756 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  42.86 
 
 		 184 aa  52.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  30 
 
 		 509 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  25.09 
 
 		 1471 aa  51.6  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.29 
 
 		 1441 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.59 
 
 		 929 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  40 
 
 		 765 aa  50.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  31.15 
 
 		 1581 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.76 
 
 		 984 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  34.48 
 
 		 550 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.79 
 
 		 815 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  40.19 
 
 		 801 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  36.36 
 
 		 470 aa  48.9  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.77 
 
 		 986 aa  48.5  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.97 
 
 		 1007 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  29.2 
 
 		 425 aa  48.5  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.86 
 
 		 471 aa  48.5  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.61 
 
 		 1212 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 578 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 639 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.19 
 
 		 1338 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  40 
 
 		 743 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.01 
 
 		 1564 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.62 
 
 		 487 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  34.62 
 
 		 487 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.56 
 
 		 755 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.5 
 
 		 1517 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  32 
 
 		 1060 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.36 
 
 		 472 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  33.9 
 
 		 433 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.36 
 
 		 472 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.65 
 
 		 480 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  35.09 
 
 		 475 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  25.25 
 
 		 557 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  37.93 
 
 		 524 aa  46.2  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.71 
 
 		 640 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.38 
 
 		 722 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  29.59 
 
 		 1368 aa  45.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.35 
 
 		 470 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1182  hypothetical protein  25.32 
 
 		 414 aa  44.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  32.14 
 
 		 558 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.69 
 
 		 712 aa  44.3  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>