126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0825 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 478 aa  991    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  40.15 
 
 		 1441 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.18 
 
 		 953 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  40.44 
 
 		 1070 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  37.69 
 
 		 1103 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  38.06 
 
 		 1059 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  40.48 
 
 		 637 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.69 
 
 		 756 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  37.65 
 
 		 752 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  40.32 
 
 		 850 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  39.52 
 
 		 801 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  40.37 
 
 		 1581 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 		 578 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  32 
 
 		 732 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  32.07 
 
 		 999 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.53 
 
 		 1564 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.74 
 
 		 695 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.95 
 
 		 971 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.4 
 
 		 1117 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.86 
 
 		 984 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 1332 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  32.43 
 
 		 433 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.48 
 
 		 915 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  37 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.1 
 
 		 940 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  33.81 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  35.48 
 
 		 571 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.59 
 
 		 819 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  30.52 
 
 		 233 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.59 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.7 
 
 		 929 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 		 1171 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  34.96 
 
 		 987 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.48 
 
 		 722 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.9 
 
 		 962 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  35.29 
 
 		 588 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 		 1158 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.78 
 
 		 722 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.87 
 
 		 674 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.45 
 
 		 581 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.89 
 
 		 1274 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  22.89 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 1321 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  31.22 
 
 		 219 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.31 
 
 		 1180 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.59 
 
 		 1265 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.06 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.36 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.38 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  25.31 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  24.34 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  32.54 
 
 		 1028 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.14 
 
 		 1139 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  33.65 
 
 		 4013 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  32.06 
 
 		 1471 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.19 
 
 		 578 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  27.55 
 
 		 247 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  24.52 
 
 		 1059 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.63 
 
 		 1362 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  31.48 
 
 		 1061 aa  60.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.67 
 
 		 755 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  31.2 
 
 		 879 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.86 
 
 		 1338 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  36.61 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  22.54 
 
 		 1143 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 1184 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2680  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.38 
 
 		 1055 aa  58.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.434706  normal  0.896202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.54 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  23.3 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.91 
 
 		 1038 aa  57  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  33.65 
 
 		 487 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.65 
 
 		 487 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 		 820 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.69 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.58 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  28 
 
 		 1007 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  29.13 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.34 
 
 		 1503 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  22.17 
 
 		 1182 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  24.88 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  22.07 
 
 		 1135 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 245 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  20.52 
 
 		 1138 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 232 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  23.87 
 
 		 2117 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  23.04 
 
 		 285 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.99 
 
 		 1505 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  30.77 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 800 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.97 
 
 		 112 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  33.62 
 
 		 557 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.46 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.46 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.15 
 
 		 1142 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>