58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0731 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  60.91 
 
 		 1143 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  58.16 
 
 		 1138 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  53.06 
 
 		 1151 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  53.54 
 
 		 1182 aa  271  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  56.82 
 
 		 1135 aa  265  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  50.41 
 
 		 1142 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  58.53 
 
 		 1505 aa  260  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 232 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  54.46 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  49.79 
 
 		 247 aa  231  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  51.14 
 
 		 1444 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 800 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  41.5 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  47.37 
 
 		 895 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  46.4 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  47 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  42.98 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  41.67 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  38.25 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  37.12 
 
 		 1194 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.18 
 
 		 1200 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  35.04 
 
 		 375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  37.39 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  31.3 
 
 		 346 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  31.28 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  32.07 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  30.2 
 
 		 283 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  28.17 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.91 
 
 		 601 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  26.27 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  29.29 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  26.29 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  26.84 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.65 
 
 		 1503 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  30.12 
 
 		 639 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  29.38 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.99 
 
 		 1180 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  26.01 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.96 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.43 
 
 		 1265 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.88 
 
 		 478 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  28.16 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.11 
 
 		 1171 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  24.69 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  29.63 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  24.4 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  25.76 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  22.29 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  25.76 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  27.85 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  27.85 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  23.76 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  27.85 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  22.66 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>