61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0136 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  50.94 
 
 
217 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  50.23 
 
 
217 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  54.21 
 
 
233 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  46.54 
 
 
227 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  51.66 
 
 
228 aa  197  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  45.61 
 
 
234 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  44.86 
 
 
216 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  42.36 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  41.85 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  43.19 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  42.72 
 
 
214 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  41.35 
 
 
248 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  41.78 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  41.31 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  47.93 
 
 
221 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  161  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  38.97 
 
 
216 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  38.33 
 
 
228 aa  151  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  40.85 
 
 
214 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  39.91 
 
 
214 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  36.49 
 
 
220 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  36.49 
 
 
220 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  36.49 
 
 
220 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  29.07 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.54 
 
 
1503 aa  72.8  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  26.5 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.05 
 
 
1265 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  26.98 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.14 
 
 
1444 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  24.75 
 
 
392 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  25.76 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
232 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  25.38 
 
 
1151 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  21.94 
 
 
1135 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  24.78 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  22.99 
 
 
1138 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  26.67 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  24.29 
 
 
223 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  25.37 
 
 
255 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.4 
 
 
1505 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  24.73 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23 
 
 
1274 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  24.86 
 
 
1143 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.33 
 
 
1171 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  28.77 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  26.67 
 
 
351 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  21.67 
 
 
1182 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  23.41 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  24.24 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  25.29 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  24.74 
 
 
314 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  20.61 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.32 
 
 
1180 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  23.32 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.83 
 
 
1142 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  20.97 
 
 
292 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1261  hypothetical protein  34.07 
 
 
300 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  23.59 
 
 
285 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>