65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4188 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  95.33 
 
 		 214 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  55.87 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  53.52 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  53.05 
 
 		 213 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  45.33 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  44.65 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  44.44 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  40.85 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  39.63 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  39.35 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  37.28 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  38.79 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  33.77 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  35.9 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  32.02 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  35.21 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  31.58 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  34.4 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  33.49 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  33.49 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  33.49 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  30.59 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.46 
 
 		 1265 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.85 
 
 		 1503 aa  65.1  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  31.44 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  26.29 
 
 		 1135 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  29.71 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  25.93 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  25.65 
 
 		 1151 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.88 
 
 		 1180 aa  55.1  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.63 
 
 		 1444 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  24.56 
 
 		 375 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.53 
 
 		 1505 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  24.61 
 
 		 1182 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  23.62 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  22.69 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  23.26 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.51 
 
 		 1200 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.89 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  23.44 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  33.98 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 800 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  24.59 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  25.52 
 
 		 392 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  21.56 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  30.66 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  22.84 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  30.28 
 
 		 326 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  23.63 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  23.74 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  20.11 
 
 		 1143 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.41 
 
 		 1142 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  25.65 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  22.47 
 
 		 1138 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  24.63 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  22.43 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23 
 
 		 1274 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.11 
 
 		 1171 aa  41.6  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  30.61 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>