42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0085 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  487  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  86.21 
 
 		 232 aa  430  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  81.9 
 
 		 248 aa  411  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  79.06 
 
 		 236 aa  387  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  64.47 
 
 		 234 aa  322  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  64.04 
 
 		 228 aa  316  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  48.92 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  44.89 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  43.11 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  42.54 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  39.91 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  39.91 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  41.85 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  37.28 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  36.4 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  36.4 
 
 		 213 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  37.55 
 
 		 216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  36.4 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  34.06 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  34.93 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  34.93 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  34.93 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  32.02 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  32.02 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  25.1 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.09 
 
 		 1274 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.08 
 
 		 1265 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.11 
 
 		 1503 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  25.48 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.1 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.59 
 
 		 1180 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2558  hypothetical protein  24.29 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000292512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0612  hypothetical protein  27.95 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000107431  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  26.7 
 
 		 314 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0598  hypothetical protein  27.95 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.26 
 
 		 1171 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.79 
 
 		 478 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1276  hypothetical protein  26.14 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.415352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  34.44 
 
 		 233 aa  42  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3471  hypothetical protein  23.6 
 
 		 266 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  34.44 
 
 		 247 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>