62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3453 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  454  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  94.44 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  59.35 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  56.07 
 
 		 213 aa  264  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  56.07 
 
 		 213 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  56.07 
 
 		 213 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  56.94 
 
 		 216 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  50.94 
 
 		 225 aa  227  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  49.1 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  42.61 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  45.33 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  48.86 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  40.79 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  44.39 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  40.35 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  39.91 
 
 		 232 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  45.54 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  44.6 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  40.17 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  39.32 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  41.47 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  41.47 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  41.47 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  31.36 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.68 
 
 		 1265 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.95 
 
 		 1503 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.86 
 
 		 1274 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  29.41 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  26.73 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  29.38 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.32 
 
 		 1171 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 		 1444 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.69 
 
 		 1180 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  25.71 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  23.93 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  23.86 
 
 		 1182 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  26.56 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.07 
 
 		 392 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  30.65 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  29.58 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  26.06 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  27.37 
 
 		 351 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.6 
 
 		 1505 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  30.3 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  29.91 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  28.22 
 
 		 375 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  26.49 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  23.32 
 
 		 1138 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  27.27 
 
 		 314 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  29.23 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  25.76 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  24.87 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  27.05 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  31.19 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  22.16 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  25.4 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  21.29 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  21.88 
 
 		 1135 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  25.27 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  25.16 
 
 		 1151 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>