54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1600 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  460  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  54.21 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  56.62 
 
 		 221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  51.39 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  46.54 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  46.05 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  48.83 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  45.41 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  49.31 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  44.16 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  42.74 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  42.54 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  42.98 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  41.74 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  40.28 
 
 		 213 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  40.74 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  41.67 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  39.35 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  37.5 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  37.27 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  37.27 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  37.27 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.19 
 
 		 1265 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  30.4 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.15 
 
 		 1274 aa  78.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.86 
 
 		 1503 aa  74.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  30.73 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  28.02 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.07 
 
 		 1171 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.5 
 
 		 1180 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  29.51 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  25.52 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  23.9 
 
 		 1135 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  24.89 
 
 		 285 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  26.13 
 
 		 276 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  25.39 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.18 
 
 		 1444 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  20.72 
 
 		 1182 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  24.2 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  28.33 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  24.73 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.43 
 
 		 1505 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.59 
 
 		 478 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1261  hypothetical protein  33.62 
 
 		 300 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  23.08 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 800 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  23.35 
 
 		 255 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  22.46 
 
 		 258 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.67 
 
 		 1200 aa  41.6  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  21.39 
 
 		 1151 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>