45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  68.12 
 
 		 248 aa  334  7e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  66.81 
 
 		 232 aa  333  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  64.47 
 
 		 232 aa  322  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  66.53 
 
 		 236 aa  321  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  67.11 
 
 		 228 aa  314  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  53.28 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  49.78 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  45.41 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  49.78 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  42.61 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  43.04 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  45.61 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  41.05 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  39.91 
 
 		 214 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  40.35 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  39.91 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  39.47 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  32.75 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  37.28 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  36.4 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  36.36 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  36.36 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  36.36 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  26.36 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.03 
 
 		 1503 aa  68.6  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.21 
 
 		 1265 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.32 
 
 		 1180 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  27.31 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 1274 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  23.21 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  23.65 
 
 		 375 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  27.18 
 
 		 314 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  25.96 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.95 
 
 		 1171 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 800 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  23.76 
 
 		 1135 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  24.14 
 
 		 392 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  21.93 
 
 		 1182 aa  45.1  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  39.22 
 
 		 351 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3471  hypothetical protein  25.7 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 		 1444 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  20.52 
 
 		 275 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>