63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3860 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  95.33 
 
 
214 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  54.93 
 
 
213 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  52.11 
 
 
213 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  51.64 
 
 
213 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  49.53 
 
 
214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  44.39 
 
 
217 aa  204  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  43.72 
 
 
217 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  43.52 
 
 
216 aa  175  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  40.09 
 
 
216 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  39.91 
 
 
225 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  37.5 
 
 
227 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  36.4 
 
 
234 aa  138  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  38.32 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  32.89 
 
 
232 aa  128  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  32.02 
 
 
232 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  34.62 
 
 
236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  35.21 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  30.7 
 
 
228 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  34.4 
 
 
220 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  34.4 
 
 
220 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  34.4 
 
 
220 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  33.03 
 
 
221 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.25 
 
 
1265 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  30.14 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  31.28 
 
 
351 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.85 
 
 
1503 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  27.32 
 
 
1135 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
245 aa  58.9  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.29 
 
 
1180 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  26.18 
 
 
1151 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  29.71 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  25.93 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  26.11 
 
 
375 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 
1444 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
272 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  24.74 
 
 
1182 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  23.61 
 
 
266 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  24.12 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  26.2 
 
 
292 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  23.64 
 
 
275 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.53 
 
 
1505 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.51 
 
 
1200 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  26.42 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  23.12 
 
 
279 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  21.23 
 
 
1143 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  25.52 
 
 
392 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
800 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  23.86 
 
 
285 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.19 
 
 
1171 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  22.97 
 
 
258 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  33.98 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  23.83 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  30.66 
 
 
290 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  23.03 
 
 
1138 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.9 
 
 
1142 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  30.28 
 
 
326 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.47 
 
 
1274 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  26.42 
 
 
296 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  24.26 
 
 
262 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  24.19 
 
 
255 aa  41.6  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>