59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3256 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  702    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  38.25 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  30.79 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  29.01 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  32.11 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  27.24 
 
 		 1151 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  28.1 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  26.71 
 
 		 260 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  26.59 
 
 		 1182 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  26.74 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  28.85 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 800 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  26.07 
 
 		 1143 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1135 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  26.28 
 
 		 1444 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.7 
 
 		 1505 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  23.48 
 
 		 1138 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 232 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.28 
 
 		 1274 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.23 
 
 		 1180 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.57 
 
 		 1142 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  25.1 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  23.57 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 277 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.57 
 
 		 1503 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  22.13 
 
 		 895 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  25.12 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.63 
 
 		 1265 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.57 
 
 		 1171 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  25 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3471  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  22.79 
 
 		 1200 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  32.8 
 
 		 214 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  36.9 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  27.16 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  29.68 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  27.37 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  36.9 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  30.47 
 
 		 213 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  30.4 
 
 		 220 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  30.4 
 
 		 213 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  30.4 
 
 		 220 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  30.4 
 
 		 220 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  27.83 
 
 		 233 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.87 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  24.78 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  28.33 
 
 		 227 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  22.5 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  39.22 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  26.32 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  22.34 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  23.38 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  25.42 
 
 		 228 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  22.22 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>