74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1732 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  64.84 
 
 		 392 aa  296  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  65.3 
 
 		 1505 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  57.8 
 
 		 1138 aa  265  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  57.89 
 
 		 1444 aa  264  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  57.14 
 
 		 1143 aa  254  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  52.86 
 
 		 1182 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  55.45 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  51.6 
 
 		 1135 aa  235  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  48.47 
 
 		 1151 aa  229  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  51.64 
 
 		 895 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  48.62 
 
 		 1142 aa  222  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 800 aa  221  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  47.27 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  46.61 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  48 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  43.3 
 
 		 260 aa  201  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  44 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.13 
 
 		 1200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  43.89 
 
 		 1194 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 277 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  41.07 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  41.41 
 
 		 375 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  37.29 
 
 		 346 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  37.18 
 
 		 292 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  31.76 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  29.88 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  91.7  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.51 
 
 		 601 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  29.69 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  27.39 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  27.85 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6776  40-residue YVTN beta-propeller repeat protein  25.87 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.83 
 
 		 1503 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  26.23 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  28.46 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  27.56 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  29.49 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.85 
 
 		 1265 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.95 
 
 		 1171 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  30.29 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.13 
 
 		 1180 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  26.58 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  26.8 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  31.97 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  25.77 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  25.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  25.77 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  25.51 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  25.86 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  26.6 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.84 
 
 		 478 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  27.27 
 
 		 327 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.87 
 
 		 1274 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  26.67 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  26.23 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  25.85 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  24.83 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  27.62 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  25.58 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  24.64 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  23.23 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  27.37 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  24.29 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  24.87 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  26.53 
 
 		 1439 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  31.16 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  24.15 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  20 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  23.23 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2270  hypothetical protein  27.23 
 
 		 223 aa  42  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>