112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2803 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  43.63 
 
 		 1171 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  43.06 
 
 		 1274 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  43.24 
 
 		 1265 aa  732    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1503 aa  3098    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.9 
 
 		 1180 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.57 
 
 		 1149 aa  224  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.11 
 
 		 1162 aa  208  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.58 
 
 		 1084 aa  187  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.85 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.79 
 
 		 1181 aa  184  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.52 
 
 		 1193 aa  176  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.39 
 
 		 712 aa  168  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  28.84 
 
 		 1139 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 		 1055 aa  156  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.09 
 
 		 1286 aa  155  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.23 
 
 		 1201 aa  154  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.16 
 
 		 1306 aa  154  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.23 
 
 		 1040 aa  152  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.84 
 
 		 1027 aa  147  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.93 
 
 		 957 aa  145  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.48 
 
 		 1068 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.78 
 
 		 951 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.11 
 
 		 852 aa  139  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.06 
 
 		 749 aa  139  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  26.04 
 
 		 756 aa  128  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.56 
 
 		 762 aa  126  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  23.94 
 
 		 1110 aa  125  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.12 
 
 		 759 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.44 
 
 		 868 aa  104  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.93 
 
 		 1390 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.28 
 
 		 773 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  22.97 
 
 		 1141 aa  89  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.77 
 
 		 864 aa  88.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  29.63 
 
 		 219 aa  87.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  30.73 
 
 		 217 aa  86.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  29.95 
 
 		 217 aa  84.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  31.45 
 
 		 168 aa  83.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  25.49 
 
 		 1058 aa  80.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.08 
 
 		 968 aa  81.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  30.57 
 
 		 296 aa  80.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  22.69 
 
 		 1143 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  32.55 
 
 		 1151 aa  79.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  30.89 
 
 		 1135 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 232 aa  77  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  25.77 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.23 
 
 		 1444 aa  75.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  27.14 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  29.76 
 
 		 279 aa  75.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  27.45 
 
 		 213 aa  74.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  30.26 
 
 		 247 aa  74.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  29.86 
 
 		 227 aa  74.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  27.62 
 
 		 1142 aa  73.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  33.16 
 
 		 276 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  30.54 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  32.2 
 
 		 255 aa  72  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  27.1 
 
 		 275 aa  72  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  23.73 
 
 		 245 aa  72  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  21.79 
 
 		 1137 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  26.36 
 
 		 1138 aa  69.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.37 
 
 		 1023 aa  69.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  29.86 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  69.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 1505 aa  68.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 		 1200 aa  68.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  30.23 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  27.03 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  25.37 
 
 		 213 aa  68.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  29.33 
 
 		 233 aa  68.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.08 
 
 		 392 aa  68.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  26.09 
 
 		 260 aa  66.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  28.12 
 
 		 1194 aa  66.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  27.93 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  27.93 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  27.62 
 
 		 228 aa  66.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  28.22 
 
 		 1142 aa  66.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  29.01 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  29.1 
 
 		 924 aa  65.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  26.88 
 
 		 1143 aa  65.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  24.76 
 
 		 214 aa  65.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 245 aa  65.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  29.03 
 
 		 351 aa  63.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  25.7 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  25.12 
 
 		 902 aa  62.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  26.74 
 
 		 314 aa  62  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  26.57 
 
 		 1439 aa  61.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  24.77 
 
 		 232 aa  61.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  25.1 
 
 		 292 aa  61.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  27.37 
 
 		 895 aa  60.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  24.68 
 
 		 248 aa  60.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  34.91 
 
 		 1077 aa  60.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  23.16 
 
 		 874 aa  60.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 800 aa  58.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  26.99 
 
 		 233 aa  58.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  25.91 
 
 		 236 aa  57  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  23.11 
 
 		 232 aa  55.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.34 
 
 		 478 aa  55.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  23.01 
 
 		 228 aa  55.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  25.85 
 
 		 214 aa  54.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  25.85 
 
 		 214 aa  52.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>