152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3060 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1027 aa  2126    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  52.16 
 
 		 868 aa  942    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  62.12 
 
 		 1040 aa  1321    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  48.28 
 
 		 1201 aa  905    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.98 
 
 		 1023 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.9 
 
 		 968 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.66 
 
 		 1149 aa  234  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.33 
 
 		 1181 aa  205  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.68 
 
 		 1162 aa  191  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  27.35 
 
 		 1110 aa  167  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.62 
 
 		 705 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.84 
 
 		 1503 aa  146  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28 
 
 		 1180 aa  141  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  28.96 
 
 		 1439 aa  141  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.4 
 
 		 864 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.71 
 
 		 1306 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.96 
 
 		 1068 aa  135  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.11 
 
 		 1171 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  24.35 
 
 		 1139 aa  127  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.37 
 
 		 1193 aa  125  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.19 
 
 		 1055 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.34 
 
 		 1286 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.04 
 
 		 1265 aa  121  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.86 
 
 		 1274 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  24.76 
 
 		 1141 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  22.18 
 
 		 1143 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.59 
 
 		 1084 aa  115  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  24.26 
 
 		 1137 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.52 
 
 		 852 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.08 
 
 		 1390 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  24.96 
 
 		 1058 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.45 
 
 		 957 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.74 
 
 		 712 aa  99.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.58 
 
 		 759 aa  99  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.19 
 
 		 762 aa  97.8  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  22.91 
 
 		 756 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  23.43 
 
 		 874 aa  87.8  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.26 
 
 		 951 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  32.37 
 
 		 880 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.94 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  25.87 
 
 		 546 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.87 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  25.84 
 
 		 381 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.06 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  26.35 
 
 		 1142 aa  72  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.52 
 
 		 428 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  24.08 
 
 		 617 aa  69.7  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  31.34 
 
 		 924 aa  68.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  25.57 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.4 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  24.57 
 
 		 369 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.71 
 
 		 428 aa  67  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  24.39 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.96 
 
 		 419 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  28.36 
 
 		 898 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  23.4 
 
 		 363 aa  63.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  23.78 
 
 		 363 aa  63.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  24.19 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  24.74 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  25.83 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  23.94 
 
 		 369 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  30 
 
 		 902 aa  61.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  24.92 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.15 
 
 		 420 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.3 
 
 		 361 aa  60.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  25.76 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  26.65 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  26.52 
 
 		 168 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  22.63 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  26.65 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  24.79 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  23.65 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.07 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  25.15 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.23 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  23.69 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  25.57 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.72 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.5 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  26.27 
 
 		 446 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  26.96 
 
 		 355 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.19 
 
 		 423 aa  57.4  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  25.5 
 
 		 424 aa  57  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.78 
 
 		 362 aa  56.2  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  22.51 
 
 		 460 aa  56.2  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.08 
 
 		 422 aa  55.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  25.08 
 
 		 379 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.08 
 
 		 379 aa  55.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5070  NHL repeat containing protein  20.46 
 
 		 417 aa  55.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  22.81 
 
 		 435 aa  55.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.41 
 
 		 367 aa  55.5  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.33 
 
 		 357 aa  53.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  23.21 
 
 		 421 aa  53.5  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  23.51 
 
 		 423 aa  53.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.42 
 
 		 371 aa  53.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.11 
 
 		 749 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.92 
 
 		 427 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  27.12 
 
 		 1077 aa  52.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  22.58 
 
 		 427 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  22.58 
 
 		 427 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>